MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methylobacterium extorquens AM1 megaplasmid

Total Repeats: 5850

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_012811	CGG	2	6	1153725	1153730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5502	NC_012811	GCC	2	6	1153766	1153771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5503	NC_012811	GACC	2	8	1153790	1153797	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5504	NC_012811	ATG	2	6	1153833	1153838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_012811	CCA	2	6	1153924	1153929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5506	NC_012811	TGG	2	6	1153948	1153953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_012811	TGG	2	6	1153998	1154003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_012811	AGCGT	2	10	1154006	1154015	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5509	NC_012811	CGCC	2	8	1154082	1154089	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5510	NC_012811	AAG	2	6	1154138	1154143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_012811	GCT	2	6	1154150	1154155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_012811	CGG	2	6	1154161	1154166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5513	NC_012811	GCTC	2	8	1154197	1154204	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5514	NC_012811	CGG	2	6	1154213	1154218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_012811	CGC	2	6	1154239	1154244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5516	NC_012811	CTG	2	6	1154300	1154305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5517	NC_012811	GC	3	6	1154306	1154311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5518	NC_012811	CGA	2	6	1154344	1154349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5519	NC_012811	TGA	2	6	1154421	1154426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_012811	CGC	2	6	1154521	1154526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5521	NC_012811	CGG	2	6	1154532	1154537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5522	NC_012811	CGA	2	6	1154554	1154559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5523	NC_012811	CAG	2	6	1154582	1154587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_012811	CAC	2	6	1154609	1154614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5525	NC_012811	GCT	2	6	1154622	1154627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5526	NC_012811	GAT	2	6	1154674	1154679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_012811	CGT	2	6	1154729	1154734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5528	NC_012811	CCG	2	6	1154749	1154754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5529	NC_012811	CGA	2	6	1154763	1154768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_012811	GGC	2	6	1154802	1154807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_012811	ACG	2	6	1154835	1154840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5532	NC_012811	CCG	2	6	1154898	1154903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5533	NC_012811	CACG	2	8	1154965	1154972	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5534	NC_012811	GGC	2	6	1154985	1154990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_012811	CCG	2	6	1154995	1155000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5536	NC_012811	CGC	2	6	1155004	1155009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5537	NC_012811	CCT	2	6	1155168	1155173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5538	NC_012811	GCC	2	6	1155185	1155190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5539	NC_012811	TGC	2	6	1155207	1155212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5540	NC_012811	CCG	2	6	1155216	1155221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5541	NC_012811	CGA	2	6	1155291	1155296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_012811	CGCCTG	2	12	1155299	1155310	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5543	NC_012811	CGC	3	9	1155364	1155372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5544	NC_012811	TGC	2	6	1155390	1155395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_012811	GCCA	2	8	1155554	1155561	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5546	NC_012811	CGTT	2	8	1155628	1155635	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5547	NC_012811	G	6	6	1155654	1155659	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_012811	AGG	2	6	1155711	1155716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_012811	AGCA	2	8	1155728	1155735	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5550	NC_012811	CGA	2	6	1155752	1155757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5551	NC_012811	ATC	2	6	1155799	1155804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5552	NC_012811	GAT	2	6	1155828	1155833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_012811	GC	3	6	1155868	1155873	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5554	NC_012811	ACG	2	6	1155965	1155970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_012811	CAC	2	6	1156017	1156022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5556	NC_012811	GATGC	2	10	1156044	1156053	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5557	NC_012811	CGA	2	6	1156076	1156081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5558	NC_012811	GCCG	2	8	1156091	1156098	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5559	NC_012811	CCA	2	6	1156120	1156125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5560	NC_012811	CAC	2	6	1156163	1156168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5561	NC_012811	TCT	2	6	1156189	1156194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5562	NC_012811	TCG	2	6	1156249	1156254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_012811	AGC	2	6	1156264	1156269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5564	NC_012811	AGG	2	6	1156270	1156275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_012811	GTC	2	6	1156299	1156304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5566	NC_012811	CTT	2	6	1156313	1156318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5567	NC_012811	CGA	2	6	1156337	1156342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5568	NC_012811	CCG	2	6	1156349	1156354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5569	NC_012811	CG	3	6	1156372	1156377	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5570	NC_012811	CCGAG	2	10	1156379	1156388	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5571	NC_012811	TCA	2	6	1156399	1156404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5572	NC_012811	GACC	2	8	1156412	1156419	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5573	NC_012811	CGA	2	6	1156448	1156453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5574	NC_012811	CG	3	6	1156485	1156490	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5575	NC_012811	CCG	2	6	1156533	1156538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5576	NC_012811	CGT	2	6	1156552	1156557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5578	NC_012811	GCG	2	6	1156649	1156654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5579	NC_012811	CGC	2	6	1156705	1156710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5580	NC_012811	CGA	2	6	1156780	1156785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5581	NC_012811	ATGGC	2	10	1156892	1156901	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5582	NC_012811	CGA	2	6	1157095	1157100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5583	NC_012811	GTC	2	6	1157114	1157119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5584	NC_012811	CGT	2	6	1157143	1157148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5585	NC_012811	GAT	2	6	1157151	1157156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5587	NC_012811	CGC	2	6	1157296	1157301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5589	NC_012811	ATGGC	2	10	1157483	1157492	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5590	NC_012811	CGA	2	6	1157686	1157691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5592	NC_012811	GTA	2	6	1157726	1157731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5595	NC_012811	GGT	2	6	1157792	1157797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_012811	TCG	2	6	1157811	1157816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5597	NC_012811	TGA	2	6	1157824	1157829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_012811	GCG	2	6	1157903	1157908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5599	NC_012811	TCG	2	6	1157910	1157915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5601	NC_012811	CGGCT	2	10	1158026	1158035	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5602	NC_012811	GCC	2	6	1158064	1158069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5603	NC_012811	CGT	2	6	1158081	1158086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5604	NC_012811	GC	3	6	1158134	1158139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5605	NC_012811	GAT	2	6	1158169	1158174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_012811	TCG	2	6	1158208	1158213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5607	NC_012811	T	7	7	1158233	1158239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_012811	CCT	2	6	1158275	1158280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5609	NC_012811	CGC	2	6	1158298	1158303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5611	NC_012811	GTA	2	6	1158393	1158398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_012811	GGC	2	6	1158405	1158410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5613	NC_012811	CAC	2	6	1158468	1158473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5615	NC_012811	GGA	2	6	1158489	1158494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5618	NC_012811	GACA	2	8	1158657	1158664	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5619	NC_012811	GTA	2	6	1158666	1158671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_012811	CCAGCC	2	12	1158672	1158683	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
5621	NC_012811	AGGT	2	8	1158694	1158701	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_012811	GGT	2	6	1158732	1158737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_012811	TCG	2	6	1158751	1158756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5625	NC_012811	GCG	2	6	1158843	1158848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5626	NC_012811	TCG	2	6	1158850	1158855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5628	NC_012811	CGGCT	2	10	1158955	1158964	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5629	NC_012811	GCC	2	6	1158993	1158998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5630	NC_012811	CGT	2	6	1159010	1159015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5631	NC_012811	GC	3	6	1159063	1159068	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5632	NC_012811	GAT	2	6	1159098	1159103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5642	NC_012811	GGA	2	6	1159418	1159423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5650	NC_012811	GCAA	2	8	1162412	1162419	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5752	NC_012811	CCGCT	2	10	1206472	1206481	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.